Резекція верхівки кореня є альтернативою видаленню і необхідна для того, щоб зберегти зуб. Застосовується найчастіше для передніх зубів, в разі формування на корені вогнища запалення. Спочатку проводиться лікування кореневого каналу, після чого видаляється вогнище запалення. При лікуванні важких форм періодонтиту проводиться відсікання верхньої частини кореня зуба разом з кістою або гранулемою. Операція проводиться з боку порожнини рота, не залишаючи ніяких зовнішніх слідів.